Nginx禁止目录执行脚本权限方法和Apache的类似都是在对应配置文件中加入如下代码?式。
禁用单个目录：

location /upload/ {
  location ~ .*.(php)?$
    {
      deny all;
    }
  }
禁用多个目录：
ocation ~* ^/(upload|images)/.*.(php|php5)$
{
    deny all;
}